Mikrobiota, czyli ogół mikroorganizmów żyjący w danym siedlisku (zarówno pato jak i niepatogennych) w kontekście medycyny żyjących w i na ciele człowieka w ostatnich latach stała się przedmiotem ogromnej liczby badań naukowych. Jej skład ilościowy i jakościowy okazuje się być dobrym miernikiem zdrowia, a także zmienia się w wielu jednostkach chorobiwych.
Warto przyswoić sobie również pojęcie mikrobiomu. Ludzki mikrobiom to wszystkie genomy mikrobioty człowieka. Okazuje się, że nie tylko same mikroorganizmy mogą być wykorzystywane w diagnostyce i prognozowaniu rokowania , ale również ich geny.
Przykładem mogą być nowotwory głowy i szyi. Specjalnie znakowany gen 16S rRNA V3-V5 wykorzystano w celu porównania rodzaju mikrobiomu w ślinie osób chorych na raka jamy ustnej i gardła , raka płaskonabłonkowego jamy ustnej oraz osób zdrowych. Scharakteryzowano również mikrobiotę zawartą w ślinie chorych pacjentów również przed i po resekcji chirurgicznej.
Przeprowadzone analizy wskazały przewagę pewnych rodzajów bakterii (Firmicutes, Proteobacteria i Bacteroidetes ) u osób chorych na raka przed operacją. Ponadto pacjenci z rakiem płaskonabłonkowym jamy ustnej mieli znacznie mniej różnorodną florę bakteryjną niż osoby z grupy kontrolnej. Skład mikrobioty zmieniał się po operacji i w razie nawrotu raka. Wyniki badania sugerują, że mikroorganizmy mogą być w przyszłości stosowane jako diagnostyczne i prognostyczne biomonitory raków głowy i szyi.
Źródło: Rafael Guerrero-Preston1,2, Filipa Godoy-Vitorino3, Anne Jedlicka4 et al. 16S rRNA amplicon sequencing identifies microbiota associated with oral cancer, human papilloma virus infection and surgical treatment, Oncotarget. 2016 May 30.